Les échantillons sont classés par ordre de préférence du laboratoire d'analyse (AHDC, Université Cornell).
1. Écouvillon (Préféré)
Aviaire (WNV) : cloacal, oropharyngé, oral, choanal
Ratites (y compris les émeus, les autruches, les nandous et les casoars du Sud) : prélèvement fécal
Les échantillons doivent être conservés au réfrigérateur (sur glace) dans un récipient étanche contenant quelques gouttes de solution saline ou 1 ml de milieu de transport viral. Les prélèvements effectués dans un milieu de culture bactérienne seront refusés.
2. Mouchoirs en papier frais
Chez les oiseaux (virus du Nil occidental) : le cerveau, le cœur et les reins sont privilégiés. D’autres tissus peuvent être acceptables en l’absence des tissus privilégiés : foie, rate, moelle osseuse.
Oiseau (EEEV) : cerveau
Équin (WNV/EEEV) : cerveau
Soumettre les échantillons réfrigérés (sur un bloc réfrigérant) dans un contenant étanche.
3. Sang total EDTA
Avian (WNV) : Sang total EDTA dans un tube à bouchon lavande.
Équin (EEEV) : Sang total EDTA dans un tube à bouchon lavande
Virus du Nil occidental équin (VNO) : le sang total EDTA peut être utilisé pour le diagnostic antemortem, cependant les niveaux de virémie sont faibles, ce qui diminue la sensibilité du diagnostic.
Remarque : Pour les tests ante mortem sur les équidés, veuillez fournir du sang total prélevé sur EDTA et du sérum. Les tests WNV PCR et EEE PCR seront effectués sur le sang total, et un test IgM ELISA sera réalisé sur le sérum pour le WNV et l’EEE (les frais des tests PCR et ELISA seront appliqués). Cette procédure devrait augmenter la probabilité de diagnostiquer une infection active.
Veuillez soumettre les échantillons réfrigérés (sur glace). Le sang total hépariné n'est pas acceptable et sera refusé.
4. Liquide céphalo-rachidien
Équin (WNV/EEEV) : LCR dans un récipient étanche.
Soumettre les échantillons réfrigérés (sur un bloc réfrigérant).
5. Tissu, bloc fixe
Tissus aviaires et équins : les blocs ou rouleaux de tissu sont acceptés. Les tubes contenant des rouleaux de 50 à 80 µm peuvent être soumis dans un contenant étanche. Des frais d’extraction supplémentaires s’appliqueront pour tout tissu fixé et un délai d’exécution prolongé peut être nécessaire en raison du temps de traitement supplémentaire.
Soumettre l'échantillon sans liquide de refroidissement.
6. Tissu, fixé
Oiseaux et équins : les tissus fixés peuvent être soumis dans un contenant étanche. Des frais supplémentaires s’appliquent pour l’inclusion des tissus fixés et l’extraction des échantillons. Un délai de traitement plus long peut être nécessaire.
Soumettre l'échantillon sans liquide de refroidissement.